השיר הזה התפרש כעל הצרות בצפון אירלנד, אבל דייב מוסטיין ציין שהשיר עוסק בישראל (אמו של מוסטיין יהודייה למרות שהוא נוצרי). בראיון ל- Rock Detector אמר מוסטיין: ''מלחמות קודש' לא מדבר על שום מקום ספציפי בזמן. זה לא מדבר על שום מדינה. זה רק אומר, 'אל תסתכל עכשיו על ישראל שאולי היא המולדת שלך''.
ברדיו הלאומי אמר מוסטיין: 'הזכרתי את ישראל בשירים בעבר, ב'מלחמות קודש'. מלחמות קודש לא חייבות להתחיל בהכרח בישראל. זה יכול להיות בכל מקום. בכל מקרה יש כל כך הרבה מלחמות קדושות בעולם עכשיו. אנשים מתים למען מטרה. זה כל כך לא ייאמן.
מוסטיין הסביר שהחצי השני של השיר נוצר בהשראת חוברת הקומיקס המעניש , שהוא אוהב (השיר של Megadeth ' Killing Is My Business...and Business is Good', הוא בערך המעניש ). לגבי החלק הראשון, הוא הסביר כשהאלבום יצא לראשונה כי מדובר בחוויה שהתרחשה באירלנד. אמר מוסטיין: ״גיליתי שה-IRA לא מתנגד לאנגלים כפי שנאמר לי. ובכל זאת הדרך שתוארה לי הייתה מאוד מרוככת. אז, יריתי את הפה שלי כשהייתי שם, ואמרתי, 'זה בשביל המטרה! אנרכיה באירלנד! תחזיר את אירלנד לאירים!' תפסתי הרבה פלאק מהעיתונות האנגלית, ותפסתי הרבה מהאירים... וכמו שאני נותן f--k ל-IRA!'
