בריאן ווילסון כתב את השיר הזה עם טוני אשר, שהיה בעל זכויות יוצרים ופרסומת שווילסון עבד איתו על שירים עבור צלילי חיות מחמד . השיר הזה משקף את העניין של ווילסון ברוחניות, וזו הייתה יציאה גדולה משירי הביץ' בויז הקודמים שעסקו בבנות, מכוניות וגלישה. ווילסון הסביר מכרה זהב ב-2011: ״טוני אשר ואני ניסינו לכתוב משהו מאוד רוחני. יש לו מנגינה דומה לשיר (מדקלם את המילים של 'The Sound Of Music'), 'I hear the sound of music...' (שר מילים ל-'God Only Knows') 'אני אולי לא תמיד אוהב אותך...' זה היה דומה לזה. טוני הגה את הכותרת 'רק אלוהים יודע'. פחדתי שיאסרו להשמיע את זה ברדיו בגלל הכותרת אבל הם לא עשו זאת״.
השיר הזה נחשב לקלאסיקה של ביץ' בויז, אבל הוא הצליח רק לגרד את הטופ 40 בארצות הברית. זה בגלל שהוא שוחרר כ-B-side, בין השאר בגלל החשש שתחנות רדיו יסרבו להשמיע שיר עם 'אלוהים' בכותרת. באוניית הערות להוצאה מחדש צלילי חיות מחמד האלבום, הסביר טוני אשר, 'באמת חשבתי שזה הולך להיות כל מה שהוא, ובכל זאת לקחנו איתו סיכונים אמיתיים. קודם כל, המילים נפתחות באמירה 'אולי לא תמיד אוהב אותך', שזו דרך מאוד לא שגרתית להתחיל שיר אהבה'.
קארל ווילסון טיפל בשירה הראשית ברצועה זו. זמן לא רב לאחר יציאת השיר, הוא אמר, 'כרגע ההשפעות שלנו הן בעלות אופי דתי. לא כל דת ספציפית אלא רעיון המבוסס על זה של תודעה אוניברסלית. הרעיון של הפצת רצון טוב, מחשבות טובות ואושר אינו דבר חדש. זה רעיון שמורים ופילוסופים דתיים מעבירים במשך מאות שנים, אבל זו גם תקוותנו. התפיסה הרוחנית של אושר ועשיית טוב לזולת חשובה ביותר למילות השירים שלנו, והאלמנט הדתי של חלק מהמוזיקה הכנסייתית הטובה יותר כלול גם בחלק מהעבודות החדשות שלנו.'
'Here, There And Everywhere' של הביטלס נוצר בהשראת השיר הזה. ג'ון לנון ופול מקרטני שמעו צלילי חיות מחמד במסיבה וחזר לביתו של לנון כדי לכתוב את זה. פול מקרטני קרא פעם ל'God Only Knows' 'השיר הכי גדול שנכתב אי פעם'.
את הקרן הצרפתית המפורסמת בשיר הזה ניגן אלן רובינסון, שהופיע בתווים של סרטים רבים, כולל צלילי המוזיקה ו עשרת הדיברות . הוא קיבל את השיחה לסשן כי הוא יכול היה לנגן בלי מוזיקה שנכתבה. בריאן ווילסון שר לו את קו הקרן שחשב עליו, ורובינסון ניגן אותו באוזן באמצעות טכניקת גליסנדו שהוצעה על ידי ווילסון.
בריאן וילסון היה מציג את זה לפעמים בתור 'השיר הראשון בעולם שאלוהים מופיע בכותרת'. אלוהים נפוץ בפזמונים ובסטנדרטים ('אלוהים יברך את אמריקה', 'קרוב יותר, אלוהים שלי, אליך'), והיה נדיר בשירי פופ, אך לא חסר תקדים; בשנת 1961 ג'וני ברנט הגיע למקום ה-18 בארה'ב עם 'God, Country And My Baby'.
בריאן ווילסון תכנן לשיר את השירה הראשית בעצמו, אבל החליט שאחיו קארל מתאים יותר לרצועה. 'חיפשתי רוך ומתיקות שידעתי שיש לקארל בעצמו וגם בקולו,' אמר בריאן.
זה הוצג בסוף הקומדיה הרומנטית משנת 2003 אהבה בעצם . זה שימש גם בסרטים לילות בוגי (הדרמה של P.T. אנדרסון על תעשיית הפורנו) ו שמור (דרמה משנת 2004 על תיכון נוצרי, שבו יש שתי גרסאות, שתי העטיפות). >>קרדיט הצעה : דייוויד - רוזוויל, MN
זה היה שיר הנושא לשלוש העונות הראשונות של סדרת הטלוויזיה HBO אהבה גדולה , שפעל בשנים 2006-2011.
נשאל על ידי האפוטרופוס איזה שיר של ביץ' בויז לקח הכי פחות מאמץ לכתוב, בריאן ווילסון ענה: 'כתבתי את 'God Only Knows' ב-45 דקות. אני וטוני אשר'.
באוטוביוגרפיה של אל קופר מעברים מאחורי הקלעים וממזרים גב , קופר מספר על הערב שביקר אצל בריאן ווילסון רק שבוע לפני כן צלילי חיות מחמד יצא לרחובות: ״בריאן שיחק לחיצת מבחן על התקליט, קפץ למעלה והפסיק את החתכים באמצע והתחיל אותם מחדש כדי להדגיש את נקודותיו. הוא היה מאוד גאה בהישג שלו, אולי אפילו קצת ראוותני, אבל לא התכוונתי להתווכח. אתה זוכר את הפעם הראשונה ששמעת את 'רק אלוהים יודע'?'
גרסת כיסוי של השיר שודרה בו זמנית בערוצי הטלוויזיה והרדיו של ה-BBC ב-7 באוקטובר 2014 כדי להשיק את BBC Music. העיבוד החדש הציג את בריאן ווילסון עצמו וכן כוכבי אורחים שונים כולל פארל וויליאמס, סר אלטון ג'ון, לורד, כריס מרטין, סטיבי וונדר, וואן דיירקשן ודייב גרוהל.
בריאן ווילסון השתעשע לראשונה ברעיון לכנות את זה 'פרד רק יודע' לפני שהחליט על 'אלוהים רק יודע'.
ג'ון לג'נד וסינתיה אריבו שיחקו את זה כדי לסמן את הקטע 'In Memorium' בטקס פרסי הגראמי בשנת 2017. היו מספר יוצא דופן של מעברים מוזיקליים באותה שנה, דיוויד בואי, פרינס וג'ורג' מייקל ביניהם.
